Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms