Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep170Q6A065 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms