Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK0

Prex1, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex1Q69ZK0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prex1Q69ZK0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prex1Q69ZK0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prex1Q69ZK0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prex1Q69ZK0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prex1Q69ZK0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Prex1Q69ZK0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prex1Q69ZK0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prex1Q69ZK0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prex1Q69ZK0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prex1Q69ZK0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prex1Q69ZK0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prex1Q69ZK0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prex1Q69ZK0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prex1Q69ZK0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prex1Q69ZK0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prex1Q69ZK0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prex1Q69ZK0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms