Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms