Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms