Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms