Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtmQ62388 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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AtmQ62388 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtmQ62388 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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AtmQ62388 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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