Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Taf6Q62311 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Taf6Q62311 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Taf6Q62311 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms