Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ttf1Q62187 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Ttf1Q62187 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ttf1Q62187 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ttf1Q62187 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ttf1Q62187 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ttf1Q62187 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ttf1Q62187 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ttf1Q62187 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ttf1Q62187 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ttf1Q62187 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms