Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms