Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms