Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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AtrxQ61687 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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AtrxQ61687 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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AtrxQ61687 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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AtrxQ61687 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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AtrxQ61687 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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AtrxQ61687 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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AtrxQ61687 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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AtrxQ61687 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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AtrxQ61687 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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AtrxQ61687 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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AtrxQ61687 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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