Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usf1Q61069 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms