Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms