Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms