Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms