Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms