Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms