Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms