Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms