Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms