Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms