Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf2Q59J78 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms