Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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