Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms