Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt35Q497I4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms