Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms