Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clpsl2Q3UW21 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clpsl2Q3UW21 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms