Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms