Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Gtpbp6Q3U6U5 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Gtpbp6Q3U6U5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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Gtpbp6Q3U6U5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Gtpbp6Q3U6U5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Gtpbp6Q3U6U5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Gtpbp6Q3U6U5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms