Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms