Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms