Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdlim7Q3TJD7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms