Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms