Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms