Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms