Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

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Length 693 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Tgm3Q08189 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Tgm3Q08189 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Tgm3Q08189 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Tgm3Q08189 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tgm3Q08189 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tgm3Q08189 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tgm3Q08189 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tgm3Q08189 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm3Q08189 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tgm3Q08189 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms