Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nf1Q04690 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms