Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Runx1Q03347 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms