Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms