Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms