Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms