Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nme2Q01768 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Nme2Q01768 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms