Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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