Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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