Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec1P97353 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec1P97353 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec1P97353 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sec1P97353 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec1P97353 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec1P97353 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sec1P97353 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sec1P97353 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec1P97353 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec1P97353 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec1P97353 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec1P97353 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec1P97353 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sec1P97353 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec1P97353 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec1P97353 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sec1P97353 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec1P97353 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sec1P97353 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec1P97353 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec1P97353 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec1P97353 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec1P97353 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec1P97353 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec1P97353 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec1P97353 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec1P97353 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec1P97353 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms