Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms