Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Irf3P70671 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Irf3P70671 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf3P70671 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf3P70671 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms