Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chl1P70232 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms