Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms